José Pomares es arquitecto por la Escuela Técnica Superior de Arquitectura de Madrid (ETSAM), completa parte de su formación en el Politecnico di Milano. Inicia su trayectoria profesional en Róterdam, trabajando en proyectos de urbanismo y vivienda en los Países Bajos. Tras una etapa profesional y docente en Madrid se traslada a París para incorporarse a Chaix & Morel et Associés y, un año más tarde, a Ateliers Jean Nouvel.
En Ateliers Jean Nouvel trabaja en numerosos proyectos internacionales de gran escala. Tras una primera etapa como arquitecto y perspectivista, desde 2008 ejerce como Jefe de Proyecto, asumiendo la dirección, coordinación y desarrollo de proyectos desde las primeras fases de diseño hasta su desarrollo técnico y construcción.
Entre los principales proyectos que dirige destaca el Jardin des Artistes de Qingdao, en China, un complejo cultural de 120.000 m² integrado en un parque de diez hectáreas. Dentro del conjunto dirige asimismo el TAG Art Museum, museo de arte contemporáneo de 16.000 m² actualmente construido.
Desde la oficina de Ateliers Jean Nouvel en Barcelona dirige la Renaissance Barcelona Fira Hotel, una torre, destinada a hotel de 356 habitaciones, de 22 plantas y 32.000 m² finalizada en 2012. Se responsabiliza del proyecto y del seguimiento de la obra hasta su finalización, así como del diseño gráfico de sus fachadas.
Durante la fase de proyecto dirige asimismo La Querola, 72 viviendas en Ordino, Andorra, y el proyecto del club Amnesia en Barcelona. Más recientemente, está al frente de una operación de gran escala en Arabia Saudí, de carácter confidencial.
A lo largo de su trayectoria en Ateliers Jean Nouvel participa también en numerosos proyectos internacionales, entre ellos: Biblioteca de la Universidad de Chipre; torre de viviendas en Nicosia; sala de conciertos y hotel en Reikiavik; viviendas y oficinas en Lisboa; torres DUO en París; así como proyectos en Barcelona, Londres, Ibiza y Seúl.
Paralelamente a su actividad como arquitecto, desarrolla una trayectoria en el ámbito de la edición. En 2006 funda Cabaret Voltaire, editorial independiente especializada en literatura contemporánea, cuya actividad compagina desde entonces con la arquitectura.